在水处理中常见的消毒设备有水箱自洁消毒器和紫外线消毒器，两者都可以为水箱消毒，并且两者都在水处理行业中有着比较高的价值，那它们究竟有什么区别呢？
1.首先两者分类不同
水箱自洁消毒杀菌器根据安装方式一般分为内置式和外置式。内置式是安装在水箱里面，而控制器安装在水箱外，需保证干燥、通风、并有防雨、防水措施。
外置式水箱自洁式消毒器安装在水箱外部，并且需要保证循环处理器水泵中心线地域水箱工作的水位。
紫外线消毒器按照水流边界不同分为封闭式和敞开式两种。封闭式紫外线消毒仪属于承压性，常用金属筒体和带石英套管的紫外线灯把被消毒的水封闭起来。封闭式消毒器一般适用于中小水量的消毒处理或者是有加压消毒或消毒器不能在明渠中使用的情况。敞开式消毒器中被消毒的水在重力作用直接经过紫外线照射消毒。
敞开式一般又可分为浸没式和水面式两种。浸没式是将带石英套管的紫外线灯放入水中，水从石英套管周围流过进行消毒，水面式是将紫外线灯直接放置与水面上，由电子管产生的平行紫外线对水体照射进行消毒。
2.其次两者的工作原理不同
水箱自洁消毒器常规原理是利用微电解电化学反应，使水中溶解的氯离子、水分子产生强氧化性物质，已达到对水体净化、消毒、杀菌、灭藻的功效。水中可以产生的强氧化物有：次氯酸、二氧化氯、活性氧、分子氯等等。上述氧化物通过扩散和循环对水箱、水池里的水及水箱内壁中含有的细菌、藻类细胞进行破坏，从而达到杀菌、灭藻的目的。
还有一种方式时利用空气通过高频高压电场，使氧转化为臭氧，并及时与水混合，利用臭氧的强氧化作用，杀灭水中的细菌。然而紫外线消毒器，是通过紫外线的照射，破坏微生物的内部结构，使其形成二聚体，使细菌死亡或不能繁殖，从而达到杀菌目的。
